Metataxonomia comparativa das regiões v2v3 vs. V4 do gene 16s em amostras de leite bovino

Resumo

A produtividade do leite é influenciada por diversos fatores, dentre eles pela ação de microrganismos deteriorantes e patogênicos. A forma padrão para identificação desses microrganismos é por meio de cultura; porém, atualmente tem-se utilizado tecnologias moleculares, como sequenciamento, que podem fornecer resultados mais rápidos e precisos, identificando muitos microrganismos de uma só vez e de maneira independente do cultivo. O objetivo deste trabalho portanto, é comparar o perfil microbiano do leite, utilizando uma nova região (V2V3) do gene 16S e verificar qual das regiões (V2V3 ou V4) tem melhor capacidade de diferenciação taxonômica a nível de gênero e espécie dos principais microrganismos do leite bovino. Para esta finalidade foram realizadas reações de PCR em 96 amostras de leite, para amplificar a região V2V3 e, em seguida, foi feito o sequenciamento e análise bioinformática. Os resultados obtidos possibilitaram a comparação a nível de gênero e espécie de ambas as regiões, concluindo que a escolha da melhor região dependerá exclusivamente do objetivo da pesquisa com base no grupo de microrganismos de interesse para identificação, pois cada região é capaz de melhor classificar taxonomicamente um grupo em detrimento a outro.